Lemmikkieläimet voivat saada joitakin samoja sairauksia, joita ihmiset voivat.
Kuten monet influenssavirukset, H1N1-virus on ylittänyt lajien linjat, tarttuvat siat, fretit, ihmiset ja jotkut kissat -mukaan lukien gepardi Kalifornian eläintarhassa. Eläinlääkärit ovat raportoineet useista kissojen tartuntataudista, mutta ne ovat raportoineet vain muutamia tapauksia viruksesta koirilla.Vaikka flunssavirukset mutatoivat nopeasti, ja tutkijat eivät voi sulkea pois mahdollisuutta, jota esiintyy tulevaisuudessa, viruksen koiran ja ihmisen välitöntä siirtoa ei ole raportoitu.
Infektiotapaukset
Kiinalaiset tutkijat ilmoittivat kahdesta ensimmäisestä H1N1-viruksen tapauksesta koirilla marraskuussa 2009. American Veterinary Medical Association ei kuitenkaan vahvista tätä,koska he eivät voineet päästä koiriin tai testien tuloksiin. Saman vuoden joulukuussa tutkijat vahvistivat kuitenkin, että New Yorkin koiralla oli virus.Koira - joka lopulta toipui eläinlääkärin hoidolla - tarttui virukseen omistajaltaan, jonka lääkärit vahvistivat, että heillä oli H1N1. H1N1: n lisäksi koirat voivat saada oman versionsa influenssasta,nimeltään H3N8, joka todennäköisesti syntyi hevosilta ennen mutaatiota sen nykyiseen muotoon.